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流感病毒屬於正粘病毒科，是一種有包膜的單鏈負鏈RNA病毒。根據核衣殼蛋白(NP)和基質蛋白(M)的抗原性差異，可分為A、B、C三種血清型；根據病毒顆粒表麵血凝素(HA)和神經氨酸酶(NA)的抗原性差異，將甲型流感病毒分為不同的亞型。典型的流感病毒呈球形，直徑80~120nm，有時呈絲狀。顆粒外層的雙脂質包膜上約有500個放射狀向外排列的突起，有：杆狀突起(HA)和蘑菇狀突起(NA)兩種類型。二者之比為(5，333，601)(4，333，601)。HAZ能引起多種動物紅細胞凝集，並介導病毒吸附到敏感的細胞表麵受體上。裂解後，HAZ可分為重鏈(HA1)和輕鏈(HA2)，兩者通過二硫鍵相連。HA的抗體能抑製凝血和中和病毒，是最重要的保護性抗體。HA表麵有五個抗原決定簇，其抗原結構容易發生變化，是甲型流感病毒亞型分類的主要依據之一。蘑菇狀的NA可以作用於粘液蛋白，釋放N_乙酰神經氨酸，將病毒從吸附的紅細胞中釋放出來，阻止毒物顆粒的聚集，促進毒物顆粒在粘液中的運動。NA抗體不能中和病毒，但可以限製病毒的繁殖，抗原結構容易改變。也是甲型流感病毒亞型分類的主要依據之一。甲型、乙型和丙型流感病毒在雙脂質包膜上也有M2 (A)、NB (B)和CM2 (C)蛋白，它們的拷貝數非常少。在內襯病毒的雙層脂質包膜下含量最高的基質蛋白是M1蛋白，它構成了病毒包膜框架。M1蛋白的抗體不能中和病毒，其抗原結構穩定，是流感病毒分類的主要依據之一。M1蛋白與病毒內部核糖核蛋白(RNP)的核心相連，呈大小不等的杆狀，由RNA和蛋白質(NP)、PB1、PB2、PA四種蛋白組成。NP是病毒核衣殼中的主要蛋白質亞單位，它包圍著病毒的基因組RNA。其抗體不能中和病毒，抗原結構穩定，具有類型特異性。它是流感病毒亞型分類的主要依據之一。PB1、PB2和PA是三種聚合酶蛋白，它們一起形成依賴RNA的RNA聚合酶複合物。與M1相連的還有非結構蛋白NS2，它在病毒複製周期中從宿主細胞核轉運合成的RNP複合物中起作用。丙型流感病毒沒有NA蛋白。

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